直接執行R腳本：RScript Caller / Running a R Script Directly in Windows: RScript Caller
以往要使用R腳本(RScript)的時候，我都是將R腳本用RStudio開啟，再用RStudio執行。但這樣子執行挺麻煩的，也不太直覺。所以我用AutoIT開發了一個直接用指令端呼叫R腳本的exe程式：RScript Caller，方便供Windows使用。這樣我們在檔案總管中直接雙擊R腳本就可以執行R腳本的內容。以下我就來介紹一下怎麼取得RScript Caller、設定與使用吧。
下載 / Download
- GitHub專案首頁：https://github.com/pulipulichen/RScript-Caller
- 下載：https://github.com/pulipulichen/RScript-Caller/archive/master.zip
下載後直接解壓縮即可。
在這裡面我們主要會用到的是以下兩個檔案：
- RScript-Caller.exe 主程式，要讓R腳本關聯到主程式
- config.ini 設定檔，設定R環境的路徑
設定 / Configuration
若要順利使用RScript Caller，我們需要在config.ini中設定好R環境的路徑，然後將R腳本關聯到RScript Caller.exe主程式。
設定檔 / config.ini
請先用文字編輯器開啟config.ini。我推薦使用Notepad++來編輯。
在這個檔案中，我們唯一要編輯的參數就是rscript_path，請設定好你安裝R環境時正確的環境。一般預設是安裝在「C:\Program Files\R\R-3.4.0\bin\x64\Rscript.exe」，但是紅字的「3.4.0」會隨著你安裝的R環境版本而有所不同。另外藍字的「x64」是64位元的版本，若是32位元的電腦，請使用「i386」。請確認該路徑真的有Rscript.exe檔案，否則RScript Caller無法順利執行喔。
關聯程式 / Associate RScript file with RScript Caller
我們用同資料夾底下的example.r來設定R腳本的關聯程式。請在該檔案上按右鍵，進入「開啟檔案」中的「選擇預設程式」。
按下右下角的「瀏覽」。
選擇「RScript-Caller.exe」，開啟。
確認RScript-Caller.exe已經正確選擇了，就可以按下「確定」。
接下來就可以看到example.r的執行結果了，如上圖所示，原來example.r是個「Hello, World!」呢！
使用 / Usage
如果有正確設置的話，那以後只要雙擊副檔名為「r」的R腳本，就會自動呼叫RScript Caller來執行。
讓我們以多組常態分佈資料之差異檢定與事後比較：R的ANOVA與Welch's anova中的R腳本為例子中的Parametric Tests for Comparing Many Non-normal Distribution Groups.R，來看看它執行的過程吧。該腳本還需要搭配ANOVA example - data.csv才能使用，所以也請一併下載吧。
整個執行過程我用ScreenToGIF錄了下來，可以看到執行的過程相當簡單，分析結果就跑出來了。以後用這個來操作R腳本就快多了呢！不過如果你是第一次執行的話，R環境需要安裝大量套件，所以需要先耐心等待喔。
結語 / In closing
有人可能會問：「為什麼不要直接關聯Rscript.exe就好了？」
在RScript Caller中，我還做了些額外的動作：
- 調整工作目錄為R腳本的所在目錄
- 在執行完R腳本後，用「pause」暫停，以方便檢視執行結果
最主要的是那個「pause」，不然執行結果會直接關閉，讓人看不到到底執行了什麼。
其實在寫RScript Caller之前，我已經有寫過呼叫Node.js的Node.js Caller。但那時候寫Node.js跟用AutoIT寫Caller的技術都不是很好，以前遇到的一些問題，這次都在RScript Caller中做了改進。
要讓RScript Caller順利運作，除了AutoIT本身要寫得好之外，最重要的是R腳本本身是完整沒有問題的。我原本都在RStudio裡面寫R腳本，沒想到RStudio幫我做了相當多的事情，導致在RScript執行的時候頻頻遭遇錯誤。一些錯誤的解法我放在這裡的留言，都是很細微的錯誤，而且相當難Google詢問，這花了我很多的時間處理。
話說回來，要讓R腳本好用，我想最重要的還是能夠使用檔案選擇GUI介面，讓使用者選擇檔案的file.choose()方法功不可沒。大家寫R腳本的時候，基本上都會把檔案路徑寫死，導致使用者在用它的時候，還要先想想R腳本用到的檔案路徑是什麼，比較麻煩。用了file.choose()之後，就可以讓使用者自行選擇，用起來更為順手。
下一個我想做的是Python Caller，Python裡面相當多好用的函式庫，偶爾我還是會用Python在分析資料。Python似乎也有互動式的檔案選擇GUI介面：tkFileDialog，下次我在改寫Python腳本的時候就來用用看吧。
這篇用RScript Caller執行R腳本的說明就到這邊囉。你平常是怎麼執行R腳本的呢？用指令列？還是用RStudio？如果你有什麼建議的話，歡迎在下面留言提出指教。如果你覺得RScript Caller還不錯用的話，請幫我在AddThis分享工具按讚、將這篇分享到Facebook等社群媒體吧！感謝你的耐心閱讀，讓我們下一篇見。
我更新了程式，讓執行結果看起來更簡潔一點
回覆刪除https://lh3.googleusercontent.com/-YSobj7TG4ik/Wn_xe6QEPzI/AAAAAAADprY/rdMncnu18hMndTI9HiJr3O9Xa5ALjEYyQCHMYCw/s0/2018-02-11_153102.jpg
如果將R腳本關聯到RScript Caller時有問題，請改用Default Program Editor，教學如下：
http://blog.pulipuli.info/2011/04/default-program-editorwindows7xmind.html
此外，昨晚也順手把Python Caller完成了XD
https://github.com/pulipulichen/Python-Caller
你好，我本身使用Windows Subsystem，可以透過command line或powershell執行Rscript的命令方式是"wsl Rscript"，例如wsl Rscript -e 1+1會順利輸出2，但我如果設定rscript_path="C:\Windows\System32\wsl.exe Rscript"，會出現錯誤"RScriprt doesn't exists in path C:\Windows\System32\wsl.exe Rscript"，我想請問有沒有辦法讓這個caller能夠同樣運作順利的方式？
回覆刪除To Worldhero,
刪除我這邊還沒有可以執行Windows中Linux的wsl，我也不太瞭解Windows跟Linux子系統之間的互動
就我的想象來說，你要在Linux中執行RScript，你需要在Linux中安裝對應的R環境。
一般來說，我們會用sudo apt-get install r-base之類的方式來安裝，詳情請看許多介紹如何在Ubuntu安裝R的教學：
https://www.digitalocean.com/community/tutorials/how-to-install-r-on-ubuntu-16-04-2
如果Linux環境有安裝R，那麼就能夠直接呼叫Rscript指令。這篇有給個例子：
http://xgenecode.com/wp/2017/11/15/install-run-r-script-linux-ubuntu/?i=1
我不確定Windows中的Linux子系統能不能抓到Windows環境裡面的東西，但我通常都是直接就Linux思維去設定，感覺比較單純。
供您參考。
最近有網友問說為什麼最後會有pause指令
回覆刪除那個pause會保留現在的視窗
沒有pause的話，執行結果會直接關閉，不方便查看結果
如果想要關閉這個功能的話，需要修改RScript-Caller.au3的程式碼並用AutoIT3重新編譯了
https://github.com/pulipulichen/RScript-Caller
感謝有這麼好用的程式
回覆刪除我目前用Rscript-Caller自動定時執行R code
但又希望是interactive R session
因為我需要用svDialogs package在中間跳出對話框讓我輸入參數
但似乎從terminal執行的R code都預設是non-interactive
查了很多地方都不知道如何解決 直接用Rscript.exe 或Rterm.exe執行也搞不定
請問有甚麼解決方案嗎
感激不盡!
你好，
刪除我Google了一下，發現有terminalExecute()這種方法
https://cran.r-project.org/web/packages/rstudioapi/vignettes/terminal.html
似乎可以研究看看？