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談DSpace 1.5.1備份機制

繼前一篇「DSpace 1.5.1安裝法」之後,今天我們來談談DSpace的備份機制,其實1.4.2或1.5.1都可以適用,因為基本架構並沒有差別太多,但本篇則是以1.5.1為主要適用對象。

要備份,就要先知道你要備份什麼東西。DSpace這個系統又區分成很多個部份,重要性不一、檔案大小也都不一定。我建議將備份機制分成這四個部份來看:

  1. DSpace原始程式的備份與還原
  2. DSpace安裝程式(排除掉assetstore)的備份與還原
  3. DSpace安裝程式中的assetstore的備份與還原
  4. DSpace資料庫的備份與還原

以下一一說明他們的功能、位置、備份與還原機制。由於大部分指令都相同,我只會在「DSpace原始程式備份與還原」有比較詳細的說明,其他的部份則挑重點說明而已。

為了方便大家安裝、使用,我先在開頭增加「快速安裝」小節,需要詳細的說明,再看看後面的小節吧。


快速安裝

  1. 下載備份與還原的腳本程式
    SkyDrive空間,zip壓縮檔,6.7KBhttp://0rz.tw/bdpr0
  2. 你可以利用Pietty或SFTP的軟體(如FileZilla)把上面下載的檔案上傳到/root/資料夾當中。
  3. 接下來解壓縮指令為unzip,然後使用chmod將權限改成700,作法大致如下:
    [root@dspace ~]# ls
    DSpace_backup_scripts.zip
    [root@dspace ~]# unzip DSpace_backup_scripts.zip
    Archive:  DSpace_backup_scripts.zip
      inflating: backup_dspace-assetstore.sh
      inflating: backup_dspace-database.sh
      inflating: backup_dspace-src.sh
      inflating: backup_dspace.sh
      inflating: backup_search.sh
      inflating: restore_dspace-database.sh
    [root@dspace ~]# chmod 700 *.sh
    [root@dspace ~]# ll
    總計 60
    -rwx------ 1 root root 2135  3月 19  2009 backup_dspace-assetstore.sh
    -rwx------ 1 root root 1727  3月 19  2009 backup_dspace-database.sh
    -rwx------ 1 root root 2139  3月 19  2009 backup_dspace.sh
    -rwx------ 1 root root 2174  3月 19  2009 backup_dspace-src.sh
    -rwx------ 1 root root 2288  3月 20  2009 backup_search.sh
    -rw-r--r-- 1 root root 7074  3月 19 15:53 DSpace_backup_scripts.zip
    -rwx------ 1 root root 3603  3月 19  2009 restore_dspace-database.sh
  4. 共有六個檔案,功能簡述如下:
    1. backup_dspace-src:備份DSpace原始程式,預設將/opt/dspace-1.5.1-src-release備份到/opt/backup/dspace-src當中
    2. backup_dspace.sh:備份DSpace安裝檔,但排除裡面的assetstore資料夾。預設將/dspace備份到/opt/backup/dspace當中
    3. backup_dspace-assetstore.sh:備份DSpace安裝檔當中的assetstore資料夾。預設將/dspace/assetstore備份到/opt/backup/dspace-assetstore當中
    4. backup_search.sh:尋找備份檔當中指定的檔案,以便於還原
    5. backup_dspace-database.sh:備份DSpace在PostgreSQL資料庫當中的資料。預設備份到/opt/backup/dspace-database當中
    6. restore_dspace-database.sh:還原資料庫資料
  5. 設定自動排程,利用vim編輯器把排程指令加入。時間可以依照實際情況進行修改,詳情請看crontab的資料。大致作法如下:
    [root@dspace ~]$ crontab -e
    ※此時會進入vim的編輯畫面讓您編輯工作!注意到,每項工作都是一行。 
    #DSpace自動備份指令,請插入在文件最後
    #每週一早上3點,執行DSpace原始程式備份
    0 3  *  *  1 /root/backup_dspace-src.sh
    #每週一早上3點30分,執行DSpace安裝程式備份
    30 3  *  *  1 /root/backup_dspace.sh
    #每週一早上4點,執行DSpace的assetstore資料備份
    0 4  *  *  1 /root/backup_dspace-assetstore.sh
    #每週一早上2點30分,執行DSpace原始程式備份
    30 2  *  *  1 /root/backup_dspace-database.sh
    #分 時 日 月 週 |<========指令========>|
  6. 設定PostgreSQL資料自動認證,注意底下設定的資料需要依據你實際的情況自行修改
    [root@dspace /]# vim ~/.pgpass
    ※請用vim編輯器輸入以下資料
    個別是「資料庫位置:資料庫連接埠:資料庫名稱:使用者名稱:使用者密碼」
    localhost:5432:dspace:dspace:dspacepassword [root@dspace /]# chmod 600 ~/.pgpass
  7. 備份的資料夾,預設是在/opt/backup當中,底下依照類型區分成四個子資料夾,各子資料夾底下再依日期建立資料夾,然後底下才是實際的備份檔。四個子資料夾個別是:
    1. dspace-src:DSpace原始程式,預設來自/opt/dspace-1.5.1-src-release
    2. dspace:DSpace安裝程式,預設來自/dspace
    3. dspace-assetstore:DSpace的assetstore資料夾,預設來自/dspace/assetstore
    4. dspace-database:DSpace的資料庫資料,預設來自於PostgreSQL
  8. 要在備份檔當中搜尋特定檔案,請執行backup_search.sh:
    [root@dspace ~]# /root/backup_search.sh
  9. 要還原資料庫資料,請執行restore_dspace-database.sh:
    [root@dspace ~]# /root/restore_dspace-database.sh

DSpace原始程式備份與還原

  • 預設位置:/opt/dspace-1.5.1-src-release
  • 備份位置:/opt/backup/dspace-src/
  • 估計壓縮之後備份檔案大小估計
    完全備份檔案大小:443MB
    最小差異備份檔案大小:16K
  • 重要性:●○○○○ 大約1周備份一次
  • 備份類型:差異備份 (只有上次備份之後變更的檔案才會納入這次備份當中)
功能與重要性說明

DSpace最原始的安裝程式,通常是由「dspace-1.5.1-src-release.tar.gz 」解壓縮而來的資料夾。這是保留了DSpace系統最原始的程式碼。修改DSpace的時候,通常都會修改原始程式,然後再進行「mvn package」等指令進行編譯。在DSpace說明書裡,通常以[dspace-src]代稱。

不過通常我在修改DSpace的時候,都是在Windows環境底下利用Dreamweaver或EmEditor之類的軟體修改、儲存,然後修改完成之後再上傳到伺服器。因此即使伺服器上的原始程式不存在也無所謂,只要重新上傳即可。

另一方面,不採用「完整備份」的理由在於DSpace原始程式在執行「mvn package」編譯之後,會佔用相當大的空間。如果每次都執行完整備份,想必硬碟空間很快就會被佔滿了。故採用差異備份,只有距離上次備份之後修改的檔案才會被納入新的備份檔案當中。

備份腳本程式(script)

接下來我們說明備份的腳本程式。程式內有些設定的部份,請依照你實際的狀況進行修改。

#!/bin/bash
# File Name: backup_dspace-src.sh
# Program:
#       這隻程式將會備份DSpace原始程式
# History:
# 2009/03/18    Pudding First release
PATH=/bin:/sbin:/usr/bin:/usr/sbin:/usr/local/bin:/usr/local/sbin:~/bin
export PATH

#顯示開始訊息
echo '執行DSpace原始程式備份…'

#取得今天日期,格式為「YYYYMMDD」,例如「20090318」
dt=`date +%Y%m%d`

#設定要備份的目標資料夾
target_path='/opt/dspace-1.5.1-src-release'
#設定要排除的目標資料夾(輸入「''」空值表示沒有資料要排除)
exclude_path=''
#設定備份的路徑(實際上會在該路徑底下建立以日期為名稱的資料夾,備份檔案則放在該資>料夾底下)
backup_path='/opt/backup/dspace-src'
#設定備份檔的檔案名稱
backup_filename='dspace-src-'$dt'.tar.gz'
#是否為差異備份?(是則填「true」,否則填「false」)

backup_differential="true"      #true || false
#設定擁有者的名稱
owner_name='dspace'
#設定擁有者的群組
owner_group='dspace'

#取得最新暫存檔的時間,存入變數$time
cd $backup_path
for i in *
do
         last_backup_time=$i
done
#把最新的時間存入變數$last_backup_time
#last_backup_time=$i

#在備份路徑底下建立資料夾,資料夾名稱為今天的日期
mkdir -p $backup_path/$dt

#設定備份的指令:差異更新
if [ "$backup_differential" == "true" ]; then
        cmd_newer="--newer="$last_backup_time
else
        cmd_newer=""
fi

#設定備份的指令:排除備份
if [ "$exclude_path" == "" ]; then
        cmd_exclude=""
else
        cmd_exclude="--exclude="$exclude_path
fi

#備份目標的檔案
tar -zcpvf $backup_path/$dt/$backup_filename $target_path $cmd_newer $cmd_exclude
#修改備份檔的擁有者
chown -R $owner_name:$owner_group $backup_path/$dt
#修改備份檔的權限,只有擁有者才能存取、寫入與執行,其他人則不行
chmod -R 700 $backup_path/$dt

#顯示備份結果相關訊息
echo "=========================================="
echo '備份的目標:'$target_path
echo '備份檔位置:'
du -h -s $backup_path"/"$dt"/"$backup_filename

#顯示結束訊息
echo '備份完成!'

請以root的身份,把這個腳本檔儲存在「/root/backup_dspace-src.sh 」當中,利用chmod將權限設定為700,然後試著執行看看能不能顯示:

[root@dspace ~]# vim /root/backup_dspace-src.sh
※請利用vim編輯器把上面的程式碼加入
[root@dspace ~]# chmod 700 /root/backup_dspace-src.sh
[root@dspace ~]# /root/backup_dspace-src.sh
執行DSpace原始程式備份…
※中間會顯示很多目錄,這是tar在打包與壓縮的檔案清單
==========================================
備份的目標:/opt/dspace-1.5.1-src-release
備份檔位置:
443M       /opt/backup/dspace-src/20090318/dspace-src-20090318.tar.gz
備份完成!
[root@dspace ~]# ll -h /opt/backup/dspace-src/20090318
總計 444M
-rwx------ 1 dspace dspace 443M  3月 18 10:17 dspace-1.5.1-src-release.bak.tar.gz
※如果有看到本日的備份檔案,表示備份完成!
排程自動執行備份

確認腳本程式可以執行之後,我們把這個程式排入自動排程當中。執行「crontab -e」指令,開啟自動排程的列表,並且在最後加入以下排程指令。排程當中的週一或3點都可以照你的意思變更,週的範圍為「0~7」,0或7都表示星期天;小時的範圍則是0~23。

[root@dspace ~]$ crontab -e
※此時會進入vim的編輯畫面讓您編輯工作!注意到,每項工作都是一行。
#每週一早上3點,執行DSpace原始程式備份
0 3  *  *  1 /root/backup_dspace-src.sh
#分 時 日 月 週 |<========指令========>|

如此就安裝完成啦。

備份檔的還原

差異備份雖然能夠節省空間,但缺點是檔案零碎,難以還原。舉例來說,我要備份test.txt的時候,會因為test.txt的修改時間不同,而會加入不同的備份檔當中。今天修改的檔案,只會加入明天的備份檔裡面。如果沒有再更動的話,則之後的備份檔都不會納入這個檔案。

備份時間點 test.txt修改時間 備份檔檔名 test.txt是否加入備份檔中?
3/17 3/16 …/20090317/backup.tar.gz
3/18 3/16 …/20090318/backup.tar.gz
3/19 3/19 …/20090319/backup.tar.gz
3/20 3/19 …/20090320/backup.tar.gz

.因此,還原前的第一步是找尋該檔案存放在哪個備份檔裡面,或著是說,看你要還原的時間點在何時。

我撰寫了一個查詢備份檔的程式,可以在多個備份檔當中,找到具有包含你指定檔名或路徑的備份檔。程式碼如下:

#!/bin/bash
# File Name: backup_search.sh
# Program:
#       找尋具有指定檔名的備份檔
# History:
# 2009/03/18    Pudding First release
PATH=/bin:/sbin:/usr/bin:/usr/sbin:/usr/local/bin:/usr/local/sbin:~/bin
export PATH

#設定備份檔案的根目錄位置
backup_root_path_default='/opt/backup'

#提示使用者輸入根目錄位置,否則自行設定預設值
read -p "請輸入備份檔根目錄的位置(預設為$backup_root_path_default):" backup_root_path
        if [ "$backup_root_path" == "" ];then
                backup_root_path=$backup_root_path_default
        fi

#移動到備份檔案根目錄,顯示有哪些備份檔類型,然後設定其一為預設值
cd $backup_root_path
echo "以下是在備份目錄當中的備份檔類型:"
ls
for d in *dspace*
do
        backup_path_default=$d
        break
done

#提示使用者輸入
read -p "請輸入備份檔的位置(預設為/opt/backup/dspace-src):" backup_path
read -p "請輸入要查詢的檔名:" filename

如果沒有輸入檔名,則結束程式
if [ "$filename" == "" ]; then
       echo "沒有要查詢的檔案,結束程式。"
       exit 0
fi

#設定路徑預設值
if [ "$backup_path" == "" ]; then
        backup_path='/opt/backup/dspace-src'
fi

#顯示訊息
echo "搜尋開始"
echo "====================================="

#要查詢的檔案列表
folder_list=$(ls $backup_path/ | tac)
for folder in $folder_list
do
        file=$(ls $backup_path/$folder/*.tar.gz)
        for f in $file
        do
                getfile=$(tar -zt -f $f | grep $filename)

                getflag="false"
                for g in $getfile
                do
                        if [ $g != "" ]; then
                                getflag="true"
                                break
                        fi
                done
                if [ "$getflag" == "true" ]; then
                        echo "[備份檔中有目標檔案:"$f"]";
                        for g in $getfile
                        do
                                echo $g
                        done
                fi
        done
done

#顯示訊息
echo "====================================="
echo "搜尋完畢"

使用方法,請直接執行之後,程式會詢問你要查詢的備份檔路徑以及你要查詢的檔名,然後稍等一下,他就會把找到的資料回報再畫面上囉,日期最新的會優先搜尋。以查詢「dspace.cfg」為例,操作過程如下,如果已經找到你要的檔案,那麼你隨時可以按「Ctrl + c」來中斷搜尋過程。

[root@dspace ~]# /root/backup_search.sh
請輸入備份檔的位置(預設為/opt/backup/dspace-src):/opt/backup/dspace-src 
請輸入要查詢的檔名:dspace.cfg 
搜尋開始
=====================================
[備份檔中有目標檔案:/opt/backup/dspace-src/20090318/dspace-1.5.1-src-release.bak.tar.gz]
opt/dspace-1.5.1-src-release/dspace/config/dspace.cfg~
opt/dspace-1.5.1-src-release/dspace/config/dspace.cfg
opt/dspace-1.5.1-src-release/dspace/target/dspace-1.5.1-build.dir/config/dspace.cfg
opt/dspace-1.5.1-src-release/dspace/target/archive-tmp/dspace.cfg.766468355.filtered
[備份檔中有目標檔案:/opt/backup/dspace-src/20090317/dspace-1.5.1-src-release.bak.tar.gz]
opt/dspace-1.5.1-src-release/dspace/config/dspace.cfg
opt/dspace-1.5.1-src-release/dspace/target/dspace-1.5.1-build.dir/config/dspace.cfg
opt/dspace-1.5.1-src-release/dspace/target/archive-tmp/dspace.cfg.766468355.filtered
=====================================
搜尋完畢
[root@dspace ~]#

找到那些備份檔,然後你可以估算一下要還原到多久之前的檔案,並利用tar指令來解壓縮,然後用cp指令覆蓋過去。 如果不熟悉Bash指令的操作,也可以用圖形介面來操作啦。指令的操作過程大致如下:

移動到有備份檔的目錄底下 
[root@dspace ~]# cd /opt/backup/dspace-src/20090317/
以tar解壓縮,解壓縮完畢之後,在該資料夾底下會建立opt目錄,也就是存放備份檔的目錄 
[root@dspace 20090317]# tar -zxf dspace-1.5.1-src-release.bak.tar.gz
移動到備份檔案裡面 
[root@dspace 20090317]# cd opt/dspace-1.5.1-src-release/dspace/config/
利用ls指令,查看是否有「dspace.cfg」 
[root@dspace config]# ls
controlled-vocabularies  item-submission.xml
crosswalks               log4j-console.properties
dc2mods.cfg              log4j-handle-plugin.properties
default.context.xml      log4j.properties
default.license          log4j.xml
dspace.cfg               Message_zh_TW_TLH.properties
dspace.cfg~              news-side.html
dstat.cfg                news-top.html
dstat.map                news-xmlui.xml
emails                   oaicat.properties
input-forms.dtd          registries
input-forms.xml          xmlui.dtd
item-submission.dtd      xmlui.xconf
利用cp指令複製dspace.cfg到現在程式的位置底下 
[root@dspace config]# cp -r dspace.cfg /opt/dspace-1.5.1-src-release/dspace/config/
cp:是否覆寫 ‘/opt/dspace-1.5.1-src-release/dspace/config/dspace.cfg’? y
移動到剛剛的備份檔目錄當中 
[root@dspace config]# cd /opt/backup/dspace-src/20090317/
利用rm指令刪除已經使用完畢的opt目錄 
[root@dspace 20090317]# rm -rf opt

DSpace安裝程式(排除掉assetstore)的備份與還原

  • 預設位置:/dspace (排除/dspace/assetstore)
  • 備份位置:/opt/backup/dspace/
  • 估計壓縮之後備份檔案大小:
    完整備份:123M
    最小差異備份:69K
  • 重要性:●●○○○ 大約1周備份一次
  • 備份類型:差異備份 (只有上次備份之後變更的檔案才會納入這次備份當中)
功能與重要性說明

DSpace在經過mvn package與ant fresh_install等安裝步驟之後,預設會安裝到「/dspace」目錄底下,你可以在原始程式的[dspace-src]/dspace/config/dspace.cfg修改這個路徑。通常在DSpace的說明書裡面,會以[dspace]代稱。這裡的資料會影響到DSpace系統的設定與運作,特別是/dspace/config裡面的設定資料。

由於DSpace安裝程式基本上也是從原始程式編譯而來,也就是說有原始程式的話,安裝程式相對上也不需要太過重複備份。因此我們採用的是差異備份,只有距離上次備份之後變更的檔案,才會被納入這次的備份檔當中。

值得一提的是/dspace/assetstore的部份需要另外處理,因為這是DSpace中典藏的數位檔案資料預設位置,不僅重要、也會佔去許多空間,下一節會有更詳細的說明。

備份腳本程式、自動排程與還原

大致上與DSpace原始程式的備份方法差不多,但是要考慮到排除/dspace/assetstore路徑底下的資料。如果你的備份路徑有所修改的話,請依照程式中的註解來修改實際的設定:

#!/bin/bash
# File Name: backup_dspace.sh
# Program:
#       這隻程式將會備份DSpace安裝程式(排除assetstore)
# History:
# 2009/03/19    Pudding First release
PATH=/bin:/sbin:/usr/bin:/usr/sbin:/usr/local/bin:/usr/local/sbin:~/bin
export PATH

#顯示開始訊息
echo '執行DSpace安裝程式備份(排除assetstore)…'

#取得今天日期,格式為「YYYYMMDD」,例如「20090318」
dt=`date +%Y%m%d`

#設定要備份的目標資料夾
target_path='/dspace'
#設定要排除的目標資料夾(輸入「''」空值表示沒有資料要排除)
exclude_path=$target_path'/assetstore'
#設定備份的路徑(實際上會在該路徑底下建立以日期為名稱的資料夾,備份檔案則放在該資>料夾底下)
backup_path='/opt/backup/dspace'
#設定備份檔的檔案名稱
backup_filename='dspace-'$dt'.tar.gz'
#是否為差異備份?(是則填「true」,否則填「false」)backup_differential="true"      #true || false
#設定擁有者的名稱
owner_name='dspace'
#設定擁有者的群組
owner_group='dspace'

#取得最新暫存檔的時間,存入變數$last_backup_time
cd $backup_path
for i in *
do
         last_backup_time=$i
done

#在備份路徑底下建立資料夾,資料夾名稱為今天的日期
mkdir -p $backup_path/$dt

#設定備份的指令:差異更新
if [ "$backup_differential" == "true" ]; then
        cmd_newer="--newer="$last_backup_time
else
        cmd_newer=""
fi

#設定備份的指令:排除備份
if [ "$exclude_path" == "" ]; then
        cmd_exclude=""
else
        cmd_exclude="--exclude="$exclude_path
fi

#備份目標的檔案
tar -zcpvf $backup_path/$dt/$backup_filename $target_path $cmd_newer $cmd_exclude
#修改備份檔的擁有者
chown -R $owner_name:$owner_group $backup_path/$dt
#修改備份檔的權限,只有擁有者才能存取、寫入與執行,其他人則不行
chmod -R 700 $backup_path/$dt

#顯示備份結果相關訊息
echo "=========================================="
echo '備份的目標:'$target_path
echo '備份檔位置:'
du -h -s $backup_path"/"$dt"/"$backup_filename

#顯示結束訊息
echo '備份完成!'

跟之前的作法一樣,請以root的身份,把這個腳本檔儲存在「/root/backup_dspace.sh 」當中,利用chmod將權限設定為700,然後利用crontab -e指令加入自動排程中吧。

[root@dspace ~]$ vim /root/backup_dspace.sh
※請把上面的程式碼插入backup_dspace.sh檔案中吧!
[root@dspace ~]$ crontab -e
※此時會進入vim的編輯畫面讓您編輯工作!注意到,每項工作都是一行。
#每週一早上3點30分,執行DSpace安裝程式備份
30 3  *  *  1 /root/backup_dspace.sh
#分 時 日 月 週 |<========指令========>|

還原方法也都跟之前相同,請利用backup_search.sh來找到保存之前檔案的備份檔吧。 


DSpace安裝程式中的assetstore的備份與還原

  • 預設位置:/dspace/assetstore
  • 備份位置:/opt/backup/dspace-assetstore/
  • 估計壓縮之後備份檔案大小:
    最大備份檔大小:端看你系統當中的資料量
    最小差異備份檔案大小:4K
  • 重要性:●●●○○ 大約3天備份一次
  • 備份類型:差異備份 (只有上次備份之後變更的檔案才會納入這次備份當中)
功能與重要性說明

DSpace當中的assetstore是存放使用者上傳資料到DSpace系統當中的實體資料資料夾。是的,你所上傳的那些圖片、影片都不會存在資料庫,而是存在這個資料夾當中。預設會安裝到「/dspace/assetstore」目錄底下,你可以在原始程式的[dspace-src]/dspace/config/dspace.cfg修改這個路徑。

assetstore資料跟資料庫的東西一樣重要、無可取代!只是變動的頻率不大。當身為機構典藏系統的DSpace運作時間一久,assetstore資料夾將會大的跟怪物一樣,因此在此我們採用差異備份策略,並縮短備份的執行時間。如果你覺得很assetstore很重要,又有足夠的空間可以做完整備份,你也可以修改備份腳本程式裡面的設定以執行完整備份。

備份腳本程式、自動排程與還原

備份腳本檔跟之前的一樣,如果你的備份路徑有所修改的話,請依照程式中的註解來修改實際的設定:

#!/bin/bash
# File Name: backup_dspace-assetstore.sh
# Program:
#       這隻程式將會備份DSpace中的assetstore
# History:
# 2009/03/19    Pudding First release
PATH=/bin:/sbin:/usr/bin:/usr/sbin:/usr/local/bin:/usr/local/sbin:~/bin
export PATH

#顯示開始訊息
echo '執行DSpace的assetstore資料備份…'

#取得今天日期,格式為「YYYYMMDD」,例如「20090318」
dt=`date +%Y%m%d`

#設定要備份的目標資料夾
target_path='/dspace/assetstore'
#設定要排除的目標資料夾(輸入「''」空值表示沒有資料要排除)
exclude_path=''
#設定備份的路徑(實際上會在該路徑底下建立以日期為名稱的資料夾,備份檔案則放在該資>料夾底下)
backup_path='/opt/backup/dspace-assetstore'
#設定備份檔的檔案名稱
backup_filename='dspace-assetstore-'$dt'.tar.gz'
#是否為差異備份?(是則填「true」,否則填「false」)backup_differential="true"      #true || false
#設定擁有者的名稱
owner_name='dspace'
#設定擁有者的群組
owner_group='dspace'

#取得最新暫存檔的時間,存入變數$last_backup_time
cd $backup_path
for i in *
do
         last_backup_time=$i
done

#在備份路徑底下建立資料夾,資料夾名稱為今天的日期
mkdir -p $backup_path/$dt

#設定備份的指令:差異更新
if [ "$backup_differential" == "true" ]; then
        cmd_newer="--newer="$last_backup_time
else
        cmd_newer=""
fi

#設定備份的指令:排除備份
if [ "$exclude_path" == "" ]; then
        cmd_exclude=""
else
        cmd_exclude="--exclude="$exclude_path
fi

#備份目標的檔案
tar -zcpvf $backup_path/$dt/$backup_filename $target_path $cmd_newer $cmd_exclude
#修改備份檔的擁有者
chown -R $owner_name:$owner_group $backup_path/$dt
#修改備份檔的權限,只有擁有者才能存取、寫入與執行,其他人則不行
chmod -R 700 $backup_path/$dt

#顯示備份結果相關訊息
echo "=========================================="
echo '備份的目標:'$target_path
echo '備份檔位置:'
du -h -s $backup_path"/"$dt"/"$backup_filename

#顯示結束訊息
echo '備份完成!'

跟之前的作法一樣,請以root的身份,把這個腳本檔儲存在「/root/backup_dspace-assetstore.sh 」當中,利用chmod將權限設定為700,然後利用crontab -e指令加入自動排程中吧。

[root@dspace ~]$ vim /root/backup_dspace-assetstore.sh
※請把上面的程式碼插入backup_dspace-assetstore.sh檔案中吧! 
[root@dspace ~]$ crontab -e
※此時會進入vim的編輯畫面讓您編輯工作!注意到,每項工作都是一行。
#每週一早上4點,執行DSpace的assetstore資料備份
0 4  *  *  1 /root/backup_dspace-assetstore.sh
#分 時 日 月 週 |<========指令========>|

還原方法也都跟之前相同,請利用backup_search.sh來找到保存之前檔案的備份檔吧。


DSpace資料庫的備份與還原

  • 預設位置:從PostgreSQL資料庫當中匯出
    ※實體檔案在PostgreSQL預設安裝位置/var/lib/pgsql/data/base/當中,但不同電腦的PostgreSQL並不能用這些檔案來作匯出匯入,要實際執行匯出匯入指令才行!
  • 備份位置:/opt/backup/dspace-database/
  • 估計壓縮之後備份檔案大小估計:
    最小備份檔案:32K
  • 重要性:●●●●● 大約每天備份一次
  • 備份類型:完整備份 (每一份備份檔都能夠完整還原)
功能與重要性說明

DSpace系統使用資料庫,預設是使用PostgreSQL,我們這邊介紹的也是針對PostgreSQL的備份與還原方法。資料庫的資料變更頻率非常高,同樣的也是無可取代的珍貴資料,建議每天備份一次。DSpace在PostgreSQL中的資料幾乎都是文字資料,因此壓縮之後的檔案大小也應該可以接受。有個參考數據是,某教育部計畫的DSpace塞了12萬多筆item之後,每次資料庫完整備份大小約40MB。至於實體的檔案則是保存在[dspace]/assetstore當中,資料庫只有儲存實體檔案的相關資訊與位置等資料,而不是真正佔吃空間的部份。

備份腳本程式(script)

這次的備份腳本跟之前不同,由於資料來源是要從PostgreSQL資料庫當中匯出,所以作法有些改變。另外程式內有些設定的部份,請依照你實際的狀況進行修改。

有一個部份必需要特別說明,PostgreSQL可以把資料庫匯出成為sql或tar打包檔,但是根據我自己的測試,只有匯出成tar打包檔才能正確地再度匯入以還原資料庫。故以下的程式當中我們是把資料庫的資料匯出成為tar檔,再進行壓縮的動作。而還原的時候我們也是以tar打包檔的狀態還原,請看下一節的程式碼說明吧。

#!/bin/bash
# File Name: backup_dspace-database.sh
# Program:
#       這隻程式將會備份DSpace的資料庫
# History:
# 2009/03/19    Pudding First release
PATH=/bin:/sbin:/usr/bin:/usr/sbin:/usr/local/bin:/usr/local/sbin:~/bin
export PATH

#顯示開始訊息
echo '執行DSpace資料庫備份…'

#取得今天日期,格式為「YYYYMMDD」,例如「20090318」
dt=`date +%Y%m%d`

#設定要備份的資料庫名稱
database_name='dspace'
#設定資料庫的擁有者
database_owner='dspace'
#設定備份的路徑(實際上會在該路徑底下建立以日期為名稱的資料夾,備份檔案則放在該資>料夾底下)
backup_path='/opt/backup/dspace-database'
#設定備份檔的檔案名稱
backup_filename='dspace-database-'$dt'.gz'
#設定擁有者的名稱
owner_name='dspace'
#設定擁有者的群組
owner_group='dspace'

#匯出的打包檔檔名 
database_tar=$(echo $backup_filename | sed s/".gz"/""/g)

#在備份路徑底下建立資料夾,資料夾名稱為今天的日期
mkdir -p $backup_path/$dt
#移動到備份資料夾
cd $backup_path/$dt

#資料庫匯出,重整資料庫,然後壓縮
pg_dump $database_name -U $database_owner | gzip > $backup_filename

#修改備份檔的擁有者
chown -R $owner_name:$owner_group $backup_path/$dt
#修改備份檔的權限,只有擁有者才能存取、寫入與執行,其他人則不行
chmod -R 700 $backup_path/$dt

#顯示備份結果相關訊息
echo '備份目標資料庫:'$database_name
echo '備份檔位置:'
du -h -s $backup_path"/"$dt"/"$backup_filename

#顯示結束訊息
echo '備份完成!'

請以root的身份,把這個腳本檔儲存在「/root/backup_dspace-database.sh 」當中,利用chmod將權限設定為700,然後試著執行看看能不能顯示:

[root@dspace ~]# vim backup_dspace-database.sh
※請利用vim編輯器把上面的程式碼加入
[root@dspace ~]# chmod 700 /root/backup_dspace-database.sh
[root@dspace ~]# /root/backup_dspace-database.sh
執行DSpace資料庫備份…
備份目標資料庫:dspace
備份檔位置:
32K     /opt/backup/dspace-database/20090319/dspace-database-20090319.tar.gz
備份完成!
[root@dspace ~]# ll -h /opt/backup/dspace-database/20090319
總計 32K
-rwx------ 1 dspace dspace 27K  3月 19 06:33 dspace-database-20090319.tar.gz
※如果有看到本日的備份檔案,表示備份完成!
設定PostgreSQL自動認證功能

如果你的PostgreSQL連線設定(/var/lib/pgsql/data/pg_hba.conf)中連線類型不是trust,那麼在執行上面的備份指令時,系統會提示你輸入密碼。

[root@dspace ~]# /root/backup_dspace-database.sh
執行DSpace資料庫備份…
密碼:
※出現「密碼:」的時候,你要手動輸入資料庫密碼才行 
==========================================
備份目標資料庫:dspace
備份檔位置:
32K     /opt/backup/dspace-database/20090319/dspace-database-20090319.tar.gz
備份完成!

為了能讓自動備份的時候順利進行,免去輸入密碼的困擾,我們要在使用者家目錄底下新增.pgpass檔案,輸入自動認證的資料。作法如下:

[root@dspace /]# vim ~/.pgpass
※請用vim編輯器輸入以下資料,個別是「資料庫位置:資料庫連接埠:資料庫名稱:使用者名稱:使用者密碼」 localhost:5432:dspace:dspace:dspacepassword
[root@dspace /]# chmod 600 ~/.pgpass
※修改權限才能生效! 

詳細的作法,可以參考我寫的另外一篇說明「PostgreSQL連線設定與DSpace資料庫備份設定」。

排程自動執行備份

自動排程的設定沒有差別,大致上設定如下:

[root@dspace ~]$ crontab -e
※此時會進入vim的編輯畫面讓您編輯工作!注意到,每項工作都是一行。
#每週一早上2點30分,執行DSpace原始程式備份
30 2  *  *  1 /root/backup_dspace-database.sh
#分 時 日 月 週 |<========指令========>|
備份檔的還原

資料庫的備份檔案,要用資料庫的匯出指令來還原,我寫了一份還原的腳本程式。你需要指定備份檔的位置、日期、檔名、資料庫名稱、資料庫使用者。內容如下:

#!/bin/bash
# File Name: restore_dspace-database.sh
# Program:
#       這隻程式將會還原PostgreSQL資料庫的資料
# History:
# 2009/03/19    Pudding First release
PATH=/bin:/sbin:/usr/bin:/usr/sbin:/usr/local/bin:/usr/local/sbin:~/bin
export PATH

#提示使用者輸入備份檔的位置
read -p "請輸入備份檔的位置(預設為/opt/backup/dspace-database):" backup_path
	#設定備份檔位置的預設值
	if [ "$backup_path" == "" ]; then
	        backup_path='/opt/backup/dspace-database'
	fi

#顯示該備份檔位置底下,有哪些日期,並將預設值設為最新的日期
echo "(該備份檔位置底下有以下日期的資料:)"
ls $backup_path
backup_dates=$(ls $backup_path | tac)
for d in $backup_dates
do
	backup_date_default=$d
	break
done

#提示使用者輸入備份檔的日期
read -p "請輸入備份檔的日期(格式為YYYYMMDD,預設為$backup_date_default):" backup_date
	#設定預設備份檔的日期
	if [ "$backup_date" == "" ]; then
	        backup_date=$backup_date_default
	fi

#顯示該路徑底下有哪些備份檔案,並取得預設備份檔的檔名
echo "(該日期的備份檔位置底下有以下備份檔的資料:)"
ls $backup_path"/"$backup_date
cd $backup_path"/"$backup_date
backup_files=$(ls *.gz)
for f in $backup_files
do
	backup_filename_default=$f
	break
done

#提示使用者輸入預設檔名
read -p "請輸入備份檔的檔名(預設為$backup_filename_default):" backup_filename
	#設定備份檔的預設值
	if [ "$backup_filename" == "" ]; then
		backup_filename=$backup_filename_default
	fi

#提示使用者輸入資料庫相關資訊
read -p "請輸入要還原的資料庫名稱(預設是dspace):" database_name
read -p "請輸入要還原的資料庫擁有者(預設是dspace):" database_owner

#設定預設值
if [ "$database_name" == "" ]; then
        database_name='dspace'
fi
if [ "$database_owner" == "" ]; then
        database_owner='dspace'
fi

#提示使用者是否要先備份資料庫
read -p "是否要先備份資料庫?(y或是n,預設是y)" backup_before
if [ "$backup_before" == "" ]; then
        backup_before='y'
fi
database_tar=$(echo $backup_filename | sed s/".gz"/""/g)

#如果要先做備份的話,則執行以下指令
if [ "$backup_before" == "y" ]; then
	read -p "資料庫備份的腳本檔案是?(預設是/root/backup_dspace-database.sh)" backup_script
	if [ "$backup_script" == "" ]; then
		backup_script="/root/backup_dspace-database.sh"
	fi
	$backup_script
fi

#提示確認還原
echo "還原目標資料庫:"$database_name
echo '來源的備份檔:'$backup_path"/"$backup_date"/"$backup_filename

echo "請確認上面訊息是否正確,還原資料庫將會覆蓋現有資料庫的所有資料!"
read -p "如要繼續,請輸入yes:" restore_check

if [ "$restore_check" != "yes" ]; then
        echo "取消還原!"
        exit 0
fi

#顯示開始訊息
echo '=========================================='
echo '執行DSpace資料庫還原作業…'

#移動到備份檔所在位置
cd $backup_path"/"$backup_date

is_targz=$(echo "$backup_filename" | grep ".tar.gz")
if [ "$is_targz" == "" ]; then
	#gz式匯入法
	echo "以psql還原……"
	gunzip -c $backup_filename | psql $database_name -U $database_owner
else
	#tar.gz式pg_restore法
	echo "以pg_restore還原……"
	#解壓縮檔案
	tar -zxf $backup_filename
	#匯入PostgreSQL
	pg_restore -c -d $database_name -U $database_owner -W $database_tar
	#移除剛剛解壓縮的備份檔
	rm -f $database_tar
fi


#重整PostgreSQL
echo "重整PostgreSQL…"
psql -c ANALYZE -U $database_owner

#顯示備份結果相關訊息
echo '=========================================='
echo '還原目標資料庫:'$database_name
echo '來源的備份檔:'$backup_path"/"$backup_date"/"$backup_filename

#顯示結束訊息
echo '還原完成!'

請利用vim編輯器把以上程式碼加入/root/restore_dspace-database.sh。執行資料庫還原腳本程式,程式會提醒你輸入相關的資訊。還原資料庫需要多多注意,進行還原的時候會覆蓋原有資料庫的資料!實際操作的情況如下:

[root@dspace ~]# /root/restore_dspace-database.sh
請輸入備份檔的位置(預設為/opt/backup/dspace-database):
(該備份檔位置底下有以下日期的資料:)
20090318  20090319
請輸入備份檔的日期(格式為YYYYMMDD,預設為20090319):
(該日期的備份檔位置底下有以下備份檔的資料:)
dspace-database-20090319.tar  dspace-database-20090319.tar.gz
請輸入備份檔的檔名(預設為dspace-database-20090319.tar.gz):
請輸入要還原的資料庫名稱(預設是dspace):
請輸入要還原的資料庫擁有者(預設是dspace):
是否要先備份資料庫?(y或是n,預設是y)
資料庫備份的腳本檔案是?(預設是/root/backup_dspace-database.sh)
執行DSpace資料庫備份:
==========================================
備份目標資料庫:dspace
備份檔位置:
32K     /opt/backup/dspace-database/20090319/dspace-database-20090319.tar.gz
備份完成!
==========================================
還原目標資料庫:dspace
來源的備份檔:/opt/backup/dspace-database/20090319/dspace-database-20090319.tar.gz
請確認上面訊息是否正確,還原資料庫將會覆蓋現有資料庫的所有資料!
如要繼續,請輸入yes:yes
==========================================
執行DSpace資料庫還原作業…
密碼:
※如果出現提示,此處需要輸入資料庫密碼!
pg_restore: [壓縮器(db)] PROCESSING TOC時發生錯誤:
pg_restore: [壓縮器(db)] TOC記錄5有錯誤;2615 2200 SCHEMA public postgres
pg_restore: [壓縮器(db)] could not execute query: 錯誤:  必須是schema public的擁有者
    Command was: DROP SCHEMA public;
pg_restore: [壓縮器(db)] could not execute query: 錯誤:  schema "public"已經存在
    Command was: CREATE SCHEMA public;
pg_restore: [壓縮器(db)] TOC記錄1949有錯誤;0 0 COMMENT SCHEMA public postgres
pg_restore: [壓縮器(db)] could not execute query: 錯誤:  必須是schema public的擁有者
    Command was: COMMENT ON SCHEMA public IS 'Standard public schema';
pg_restore: WARNING:  無法取消任何權限
pg_restore: WARNING:  無法取消任何權限
pg_restore: WARNING:  未被賦予任何權限
pg_restore: WARNING:  未被賦予任何權限
警告,還原時忽略錯誤:3
※還原的時候出現以上錯誤,這是很正常的!
重整PostgreSQL…
WARNING:  忽略"pg_authid" -- 只有資料表或資料庫擁有者能進行分析
WARNING:  忽略"pg_tablespace" -- 只有資料表或資料庫擁有者能進行分析
WARNING:  忽略"pg_pltemplate" -- 只有資料表或資料庫擁有者能進行分析
WARNING:  忽略"pg_shdepend" -- 只有資料表或資料庫擁有者能進行分析
WARNING:  忽略"pg_auth_members" -- 只有資料表或資料庫擁有者能進行分析
WARNING:  忽略"pg_database" -- 只有資料表或資料庫擁有者能進行分析
ANALYZE
※分析的時候出現以上錯誤,這也是很正常的! 
==========================================
還原目標資料庫:dspace
來源的備份檔:/opt/backup/dspace-database/20090319/dspace-database-20090319.tar.gz
還原完成!
[root@dspace ~]#

後記

終於把整個備份機制都好好地重整一遍了。光這一篇就寫了兩天……好累……不過也多虧寫這一篇,改進了很多原來我在伺服器上撰寫的不友善程式碼。

寫到最後連後記都不知道要寫什麼了……我越來越習慣Linux的Bash Shell操作,算是好事吧。

後來又加了快速安裝的章節,也發現自己少了一大部分沒有撰寫,然後又為backup_search.sh增加了一些功能……

希望這一篇會對使用DSpace的機構單位有所幫助!加油!<-- Post Catalog -->

總共15 則留言 ( 我要發問 , 隱藏留言 顯示留言 )

  1. 又增加「快速安裝」的說明
    然後修正一些部份的錯誤

    總算是弄完了,WLW統計字數8619……好多orz

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  2. 為配合同步鏡像功能,修改了PostgreSQL的備份與還原設定。

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  3. 作者已經移除這則留言。

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  4. 您好 目前我們中心的系統也是Dspace建立的 但因為年代久遠急需要備份
    可否在開放備份壓縮包下載呢 感激不盡

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  5. To 李柏鋒:

    DSpace_backup_scripts.zip 檔案重新上傳

    Box: https://app.box.com/s/goydo2abm2rdq9o21hvrj8d7cqulehsa
    Google Drive: https://drive.google.com/file/d/0B3_qgRmbvvZ1NTNmSzRpdmRtdTA/view?usp=sharing
    Evernote: https://www.evernote.com/shard/s4/nl/308055/740b07cf-b795-4858-a522-b291a59a8403?title=DSpace_backup_scripts.zip
    OneDrive: http://1drv.ms/1YMh3mu
    Mega: https://mega.nz/#!p0AzTKpB!fUNiuwWkPQguyRCG39yMDxVUbg69ndRDz-qufgaAfJY

    但不一定適用,可能因為DSpace版本不同,資料庫不同而無法使用。
    舉例來說,現在臺大機構典藏的版本是用MySQL,可是我這個版本是給PostgreSQL使用的

    請不要期待它可以正常運作喔。

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  6. 非常感謝 我是在台大工作沒錯 不過我們是用PostgreSQL

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  7. 不過 通通備份完之後 發現檔案都只有4K呢 這樣應該是失敗的吧^^"

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  8. To 李柏鋒,

    看一下4K是什麼東西就可以知道了吧?

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  9. 作者已經移除這則留言。

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  10. 作者已經移除這則留言。

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  11. 試了很久..無法解壓縮...哈

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